Celem strategicznym projektu jest  trwałe zachowanie populacji motyli  i ich siedlisk chronionych Dyrektywą Siedliskową na obszarze południowo- zachodniej Polski, na 8 obszarach Natura 2000. Eko-Unia koncentruje uwagę na rzadkich w UE motylach jak np. przeplatka aurinia Euphydryas aurinia (zdj).

Przy zakupach maszyn i urządzeń w ramach projektu brana jest pod uwagę minimalizacja zużycia energii, tym samym zmniejszenie emisji CO2 i negatywnego wpływu na klimat. Eko-Unia kieruje się optymalizacją wyboru mocy urządzeń (traktor, wykaszarki) oraz jednostkowego zużycia paliw. Chce także zapewnić możliwość korzystania przez te urządzenia z biopaliw.

Już obecnie Eko-Unia stara się minimalizować zużycie paliwa na dojazdy. Koordynator projektu używa hybrydowego auta, które w okresie letnim zużywa ok. 4,5 l/ 100 km. Sprawdzona zostanie także możliwość wykorzystania siana koszonego w projekcie, które nie znajdzie użytkowników rolnych, do celów energetycznych - w ciepłowniach lub elektrociepłowniach lokalnych. Dla przykładu w Lubaniu Śl. od lat funkcjonuje ciepłownia miejska opalana balotami słomy.